Las emergencias de salud animal pueden tener su origen en una serie de factores, incluidos los brotes de enfermedades animales transfronterizas de alto impacto, que pueden afectar tanto a animales terrestres como acuáticos. Las crisis humanitarias, así como los desastres naturales y los peligros químicos, biológicos, radiológicos o nucleares también pueden dar lugar también a emergencias de salud animal.